Новосибирский государственный Университет является одним из важнейших градообразующих организаций Академгородка. От эффективности его развития зависит очень многое. Его влияние на Академгородок будет только возрастать в связи с присуждением НГУ статуса Национального Исследовательского Университета.
Фонд Академгородок поддерживает развитие Университета. По инициативе и при участии Фонда «Академгородок» создан Общественный совет НГУ, представленный сильными уважаемыми людьми, среди которых выпускники НГУ, студенты, представители СОРАН, инновационного бизнеса, общественности. Совет призван способствовать всестороннему развитию Университета.